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引物设计合成

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引物设计合成

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简介:

引物合成 是通过测定引物的OD值,溶解引物,最终合成引物的一个完善的过程

引物设计有3条基本原则:

    首先引物与模板的序列要紧密互补,其次引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构,再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应(即错配)。具体实现这3条基本原则需要考虑诸多因素,如引物长度,GC含量,引物碱基分部,Tm值,引物特异性,形成引物二聚体及发夹结构的能值等等。

引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法:

   亚磷酰胺三酯法合成DNA片段,具有高效、快速的偶联以及起始反应物比较稳定的特点。亚磷酰胺三酯法是将DNA固定在固相载体上完成DNA链的合成的,合成的方向是由待合成引物的3′端向5′端合成的,相邻的核苷酸通过3′→5′磷酸二酯键连接。引物合成特点A.引物合成的纯度高。B.合成的序列长.C.合成的效果好。



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